一、教学单位

1.商学院

2.社会发展与管理学院

3. 政治学院

4.教师教育学院

5.体育学院

6.文学院

7.外国语学院

8.艺术学院

9.理学院

10.信息工程学院

11. 工学院

12.生命科学学院

13.医学院、护理学院

二、管理部门

1.党委办公室、校长办公室、档案馆

2.党委组织部、统战部

3.党委宣传部、文明办、新闻中心

4.纪委办公室、监察审计处

5.发展规划处、高等教育研究所

6.人事处、退休教工管理处

7.教务处、教师教育办公室、现代教育技术中心

8.科技处、地方服务与合作处

9. 人文社科处

10.学科规划与建设处、党委研究生工作部、研究生处

11. 实验室建设与管理处

12.对外联络处、港澳台办公室、校友联络办公室

13. 外事处、国际学院

14.计划财务处

15.招生就业处

16.党委学生工作部、学生处、人武部

17.保卫处

18.校园建设处

19.公共事务管理处、采购管理中心

20. 继续教育学院

21.后勤服务中心

三、群团组织

1.工会

2.团委

四、直属单位

1.图书馆

2. 学报编辑部

3. 湖州发展研究院

4.中国生态文明研究院、农村发展研究院

5. 资产经营有限公司

五、独立学院

1. 求真学院

六、医教单位

1. 第一临床医学院(附属第一医院)

2. 浙北临床医学院(附属中心医院)